蝙蝠是一种翼手目哺乳动物，与鸟类完全不同。尽管它们能飞，它们和鸟类有很大的区别。相比之下，蝙蝠和人类、狗、貂等哺乳动物更类似。
首先，鸟类和哺乳动物的胚胎结构非常不同。鸟类的胚胎是外卵膜胚，而蝙蝠和其它哺乳动物则是内卵膜胚。所谓卵膜胚，是指胚胎内外都有一层薄膜，而内卵膜胚的卵膜在胚胎早期已经与胚胎连接为一体，形成母体的胎盘。
另外，蝙蝠与鸟类的体温调节方式也有很大差异。蝙蝠是恒温动物，内部体温较为稳定，和哺乳动物一样。而鸟类则是温血动物，通过自身代谢来维持恒温。因此，蝙蝠不仅不是鸟类，也和鸟类不是近亲关系。
