呼吸机和制氧机在使用上都是对患者的吸氧进行辅助，但是呼吸机除了吸氧外，还可以完成有关呼吸的其他功能，例如呼气末正压、呼吸频率、潮气量、持续气道正压等等，而制氧机只能提供纯氧，没有对呼吸的其它方面的控制功能。
此外，两种机型的使用范畴也不同。呼吸机主要用于呼吸系统疾病如ARDS、COPD、肿瘤等引起的呼吸功能不全，包括住院的病人、在手术中需要气管插管的病人、移植后需要呼吸支持的病人等。而制氧机则主要用于长期吸氧或需要在家治疗的慢性阻塞性肺病（COPD）、支气管哮喘和肺纤维化患者，还有高原反应患者等。
最后，价钱上，呼吸机的价格更高比制氧机，因為呼吸机的功能更加完善，应用范围更广泛。
