洪涝灾害的原因是多方面的。主要是由于久雨不止、暴雨倾盆、雨量过大，导致水位上升，引起河水湖泊泛滥、决口、丰水期冲毁堤坝等，同时也受到地表径流、地下水的影响。这就是洪涝灾害的本质。
洪涝灾害的形成还与人类的破坏性活动密不可分，例如水库大坝、堤防等建设的原因、露天开发、城市化快速发展导致城市防洪系统建设不完善、城市低洼地区地形高低差异大等原因都会让洪涝灾害的发生更加频繁和严重。
此外，气候变化也是导致洪涝灾害形成的原因之一，全球气温升高会引起大气温湿度的增高，气候变暖引发的暴雨天气频繁，从而导致洪水泛滥。
